L'université a été fondée à Nanning , Guangxi , le 21 novembre 1934 sous le nom d'École de médecine provinciale du Guangxi (广西省立医学院), et le campus a été déplacé à Guilin en novembre 1949, peu de temps après la création de la République populaire de Chine.

Fondée en 1934, l'université est l'une des premières universités chinoises à accepter des étudiants internationaux dans son programme d'enseignement médical en anglais, qui se limite uniquement à la médecine clinique (临床医学). Les étudiants étrangers boursiers sont tenus de suivre tous leurs cours en chinois mandarin